CARA
MENGGUNAKAN APLIKASI JMOL
Jmol merupakan sofwarevisualisasi struktur
molekul dalam 3D. jangan khawatir teman-teman walaupun sangat canggih,
aplikasi ini gratis lho…baik banget kan yang bikin jmol. maka dari
itu kita harus memanfaatkan aplikasi ini dengan baik. oke…. Selain
gratis aplikasi ini kompetabel dengan os windows, mac OS X dan linux/unix.
Aplikasi ini bisa didownlod di situs resmi
Setelah diinstal di komputer, saatnya menggunakan
aplikasi ini. Penggunaan utama aplikisi ini kan untuk melihat suatu senyawa
secara tiga dimensi tetapi selain itu kita juga bisa menggambar dengan
menggunakan jmol ini. Untuk melihat suatu senyawa, data base nya bisa
di download di PupChem. Senyawa yang kita butuhkan bisa di peroleh dengan mudah
dan gratis. Di PupChem tersebut hanya tinggal ketik nama senyawa dan di
download file dengan tipe .sdf yang 3D-nya ya.
Sekarang kita akan mencoba menggunakan aplikasi ini.
Buka aplikasi Jmol, maka akan muncul tampilan seperti di bawah ini. lalu untuk
memulai menggambar molekul adalah klik:
Hasilnya adalah :
Kita bisa mengganti sesuai keinginan kita.
Semisal ini saya mencoba untuk membuat NH3.
Untuk memberi nama pada setiap atom, klik
display lalu klik label dan pilih sesuai yang anda sukai
nah kita bisa melihat bentuk molekul yang kita buat
secara 3D, dari sisi depan, atas, bawah, kanan, kiri. caranya : Klik pada
menu View ini contoh melihat pada sisi depan.....
kalau yang di bawah ini tampilan tampak dari bawah
ini :
nah selamat mencoba teman-teman. semoga bermanfaat,
amin :)
Tidak ada komentar:
Posting Komentar